DNA Ligasen
Diese Gruppe von Enzymen ist in der Lage, Einzel- und Doppel-Strang-Brüche in einem DNA Molekül zu reparieren und spielt in der Zelle eine wichtige Rolle bei der DNA Replikation und DNA Reparatur.
T4-DNA-Ligase/ T4 DNA Ligase Rapid
… katalysiert die Bildung einer Phosphodiesterbindung zwischen dem terminalen 5'-Phosphat und den 3'-Hydroxylgruppen von Duplex-DNA oder RNA. Die T4-DNA-Ligase fügt sowohl blunt ends als auch sticky ends doppelsträngiger DNA, RNA und DNA-RNA-Hybriden zusammen, einzelsträngige DNA oder RNA jedoch nur in geringem Umfang.
- Applikation: z.B. Klonierung, Adaptor Ligation
CircLigase ssDNA Ligase
Eine thermostabile Ligase, die die intramolekulare Ligation (d.h. Zirkularisierung) von ssDNA- und ssRNA-Vorlagen katalysiert.
- Intramolekulare Ligation von einzelsträngigen DNA-Enden, die 5'-Phosphate und 3'-Hydroxylgruppen enthalten
- ATP-abhängiges, katalytisches Enzym
- Zirkularisiert ssDNA mit einer Länge von 30 Basen
- Ligationsreaktionen bei hohen Temperaturen
CircLigase II ssDNA Ligase
Eine ATP-unabhängige, nicht katalytische, thermostabile Ligase, die die intramolekulare Ligation (d.h. Zirkularisierung) von ssDNA- und ssRNA-Vorlagen katalysiert.
- Intramolekulare Ligation von einzelsträngigen DNA- und RNA-Enden, die 5'-Phosphate und 3'-Hydroxylgruppen enthalten
- ATP-unabhängiges, nicht katalytisches Enzym
- Zirkularisiert ssDNA mit einer Länge von 15 Basen
- Ligationsreaktionen bei hohen Temperaturen
Ampligase Thermostable DNA Ligase
Das Enzym katalysiert die NAD-abhängige Ligation von benachbarten 3´OH- und 5´Phosphat-Enden in Duplex DNA Strukturen, die bei hohen Temperaturen stabil sind. Die aus einem thermophilen Bakterium stammende Ampligase ist bei höheren Temperaturen aktiver und stabiler als konventionelle DNA-Ligasen.
- Applikation: LCR (Ligase Chain Reaktion)-SNP Detektion
Taq-DNA-Ligase
Eine thermostabile DNA-Ligase aus Thermus aquaticus
- Applikation: LCR (Ligase Chain Reaktion)
T7 DNA Ligase
Die T7-DNA-Ligase ist eine ATP-abhängige dsDNA-Ligase aus dem Bakteriophagen T7. Das Enzym katalysiert die Ausbildung einer Phosphodiesterbindung zwischen einem 5‘ Phosphat- und einem 3’ Hydroxylende in doppelsträngiger DNA. Das Enzym ligiert dsDNA mit sticky ends.
- Applikation: Ligation von dsDNA mit cohäsiven Enden
T3 DNA Ligase
… ist eine ATP-abhängige dsDNA-Ligase aus dem Bakteriophagen T3
- Für Klonierung, Ligation und Nick-Sealing in doppelsträngiger DNA
- 2-fache Salztoleranz im Vergleich zur T4-DNA-Ligase
E. coli-DNA-Ligase
… katalysiert die Bildung von Phosphodiesterbindungen zwischen einem benachbarten 5ʹ-Phosphat und einem 3ʹ-Hydroxyl von DNA-Enden und benötigt NAD+ und Mg2+ als Kofaktoren. Die Ligation von DNA mit blunt Enden ist im Vergleich zur Ligation von kohäsiven DNA-Enden und zum Nick-Sealing äußerst ineffizient.
- Applikation: Ligation von Nicks in dsDNA (Nick Sealing)